基本上，MES系統應用于化工企業都會經過三個典型的發展階段，即信息集成階段、事務處理階段和制造智能階段。每個企業，無論其規模大小，必然經歷以上三個階段，從而最終完成其系統的建設過程。

1、信息集成階段

MES系統的主要功能之一即將企業管理和過程控制銜接起來，形成從傳感器到ERP的信息集成。因此，信息集成是流程行業ERP成功發揮作用的基礎條件，也是實施系統的第一步。

信息集成包括：與ERP信息集成；MES系統橫向信息集成；與PCS信息集成。ERP關注產品使用、顧客定單和材料需求，給發出生產更多產品或增加庫存的指令，以滿足客戶定單要求。系統負責執行產品制造和所有與產品制造有關的操作。料單和產品設計細節可以存儲在系統層，通過系統轉化為“如何生產”的指令，提供給操作者和物理設備。一旦指令、規范或其它形式的制造要求傳遞給控制層，控制層通過改變設備狀態和物流形態，滿足制造要求。每一層也會發生雙向數據交換，以反饋計劃執行情況，判斷意料之外的狀態變化、報警信息和異常事件。

2、事務處理階段

事務處理階段強調的是業務處理流程的梳理和業務處理過程的規范。要以價值鏈為工具，分析企業現有狀態，確定未來模式，最后確定MES系統事務處理功能。事務處理階段對應于決策支持的結構化決策問題，業務分析和需求分析工作量大，但軟件實現相對比較簡單、直接，其決策過程和解決方法有固定的規律可循，能用明確的語言和模型加以描述，并可依據一定的通用模型和決策規則實現其決策規程的基本自動化。

3、制造智能階段

目前，大多數MES系統只能提供信息集成和基本業務處理功能，而乏力于總結和提煉出用于生產管理和科學決策的信息。大量數據只是以各種不同類型的報表呈現，而決策好壞仍然依賴于生產管理者的經驗和直覺。一個有效的系統應該具有制造智能，即基于數據、信息、知識的綜合和分析能力，對業務運作的實際情況反應迅速，為管理者做出正確、及時的決策提供支持。

MES系統旨在提升企業執行能力，具有不可替代的作用。盡管該系統在國內的應用仍然處于初級階段,但是，從它的的應用案例中，企業用戶已經達成共識：該系統如果應用得當，企業最終能夠從中獲益。我們應該認識到系統是一種非常個性化的系統，這對企業根據自身情況合理選擇系統提出了更高的要求。在建設過程中，我們不僅要客觀地認識市場、深入理解該系統的真正含義，更要深入分析企業特點、明確企業實際需求，只有在這種基礎上建設起來的系統才會給我們的企業帶來真實的效益。